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医疗纠纷鉴定费最终承担方需根据鉴定结果来确定，若医疗机构存在过错，一般由医疗机构承担；若医疗机构无过错，则由提出鉴定的一方承担；双方都有一定责任时，按责任比例分担。
1. 医疗机构承担鉴定费的情形：当医疗纠纷经过鉴定，认定医疗机构在医疗过程中存在过错，且该过错与患者的损害后果之间存在因果关系时，鉴定费通常由医疗机构承担。这是因为医疗机构的过错行为是引发纠纷并导致鉴定程序启动的主要原因。例如，在手术过程中，医生因操作失误导致患者出现严重并发症，经鉴定该失误与并发症有直接关联，那么医疗机构就应当承担鉴定费用。这体现了过错责任原则，即有过错的一方需要对其行为所产生的后果负责，包括鉴定费用这一因纠纷产生的额外支出。
2. 提出鉴定方承担鉴定费的情形：如果鉴定结果表明医疗机构在医疗过程中不存在过错，或者其医疗行为与患者的损害后果之间不存在因果关系，那么鉴定费一般由提出鉴定申请的一方承担。比如，患者认为医疗机构的治疗导致其病情恶化而申请鉴定，但鉴定结果显示医疗机构的治疗符合规范，患者病情恶化是自身疾病发展的结果，此时提出鉴定的患者就需要自行承担鉴定费用。这是为了防止当事人随意启动鉴定程序，避免资源的浪费。
3. 双方按比例分担鉴定费的情形：在一些情况下，医疗纠纷的责任并非完全归属于某一方，而是双方都存在一定的责任。此时，鉴定费会按照双方的责任比例进行分担。例如，医疗机构在治疗过程中存在一定的疏忽，但患者自身也没有完全遵循医嘱，双方的行为都对损害后果的发生起到了一定的作用。经过责任划分，确定医疗机构承担 70%的责任，患者承担 30%的责任，那么鉴定费也会按照这个比例由双方分别承担。这种方式体现了公平原则，根据双方的过错程度来合理分配费用。
4. 特殊情况下的鉴定费承担：在某些特殊案件中，法院可能会根据案件的具体情况，综合考虑各种因素，对鉴定费的承担做出特殊的判定。例如，考虑到患者的经济状况、医疗机构的公益性质等因素。如果患者经济困难，而医疗机构具有较强的经济实力，法院可能会适当调整鉴定费的承担比例，以保障患者的合法权益。
《医疗事故处理条例》第三十四条规定，医疗事故技术鉴定，可以收取鉴定费用。经鉴定，属于医疗事故的，鉴定费用由医疗机构支付；不属于医疗事故的，鉴定费用由提出医疗事故处理申请的一方支付。鉴定费用标准由省、自治区、直辖市人民政府价格主管部门会同同级财政部门、卫生行政部门规定。
《中华人民共和国民法典》第一千二百一十八条规定，患者在诊疗活动中受到损害，医疗机构或者其医务人员有过错的，由医疗机构承担赔偿责任。在确定赔偿责任时，鉴定费作为因纠纷产生的合理费用，也会根据过错责任进行分担。
